Kierownik: Hanna Bolibok-Brągoszewska
Postdoc: Anna Hawliczek
Doktorantki: Ewa Borzęcka, Katarzyna Tofil
Studenci i praktykanci: Adam Janicki, Marcin Niewiadomski
W przeszłości:
Studenci: Marianna Droszcz, Adam Kral
Praktykanci i studenci Erasmus: Ilteris Kutlug Onal, Beyza Nur Telli, Mertcan Gulben, Simran Asawa, Macarena Pozo Morales, Timea Papp, Alexandra Kiss, Usman Khalid Chaudhry, Anna Ringauf, Kathrin Schmittner, Shivaksh Ahluvalia
Naukowcy wizytujący: Saida Sharifova
Problematyka badawcza zespołu to:
- Identyfikacja i charakterystyka rejonów genomu żyta poddanych presji selekcyjnej
- Identyfikacja genów warunkujących tolerancję niedoboru fosforu
- Charakterystyka zróżnicowania genetycznego zasobów genowych żyta przy wykorzystaniu różnych typów markerów DNA (GBS, SSR)
- Wykorzystanie wysokoprzepustowego sekwencjonowania amplikonów do identyfikacji funkcjonalnych wariantów wybranych genów w zasobach genowych
- Konstrukcja wysokorozdzielczych map genetycznych, integracja mapy genetycznej i fizycznej żyta
Projekty badawcze:
- Identyfikacja i charakterystyka genów warunkujących tolerancję niedoboru fosforu u żyta (Secale cereale L.) – rośliny o wysokiej tolerancji niedoboru składników pokarmowych, 2021-2025 – NCN OPUS19 nr 2020/37/B/NZ9/00738
- Wpływ selekcji na genom rośliny uprawnej – identyfikacja i charakterystyka sekwencji, na które nakierowana była presja selekcyjna w trakcie udomowienia i hodowli żyta (Secale cereale L.), 2015-2021, projekt NCN Sonata Bis 4 DEC-2014/14/E/NZ9/00285
- Eksploracja regionów bogatych w geny u gatunku o dużym genomie (Secale cereale L.) z wykorzystaniem markerów DArT, 29.08.2012-28.08.2015, projekt NCN Opus 2 nr 2011/03/B/NZ2/02480
- Kompleksowa charakterystyka molekularna zróżnicowania genetycznego uprawnych i dzikich form w rodzaju Secale, 29.11.2010-28.11.2013, projekt własny MNiSW, numer NN310 080139
Publikacje (5 wybranych):
Deep sampling and pooled amplicon sequencing reveals hidden genic variation in heterogeneous rye accessions
Hawliczek A, Bolibok L, Tofil K, Borzęcka E, Jankowicz-Cieślak J, Gawroński P, Kral A, Till BJ, Bolibok-Brągoszewska H. (2020) Biorvix: doi: 10.1101/2020.02.20.958181
Effective BAC clone anchoring with genotyping-by-sequencing and Diversity Arrays Technology in a large genome cereal rye.
Borzecka E, Hawliczek-Strulak A, Bolibok L, Gawronski P, Tofi K, Milczarski P, Stojalowski S, Myskow B, Targonska-Karasek M, Gradzielewska A, Smolik M, Kilian A, Bolibok-Bragoszewska H. (2018) Sci Rep 8:8428
DArT markers effectively target gene space in the rye genome
Gawroński P, Pawełkowicz M, Tofil K, Uszyński G, Sharifova S, Ahluvalia S, Tyrka M, Wędzony M, Kilian A, Bolibok-Brągoszewska H. (2016) Front Plant Sci 7:1600
Genome-wide characterization of genetic diversity and population structure in Secale
Bolibok-Brągoszewska H, Targońska M, Bolibok L, Kilian A, Rakoczy-Trojanowska M. (2014) BMC Plant Biol 14:184
Kontakt: Hanna Bolibok-Brągoszewska