Nowoczesne metody fenotypowania – seminarium

W najbliższy piątek, tj. 15 listopada 2019 r. odbędzie się seminarium naukowe „Nowoczesne metody fenotypowania roślin” organizowane przez SGGW i Instytut Genetyki Roślin PAN.

Osoby zainteresowane udziałem proszone są o potwierdzenie zamiaru przybycia na adres pkra@igr.poznan.pl do 8 listopada 2019 r.
Jednocześnie można zgłaszać chęć wygłoszenia krótkich wystąpień.

Seminaria – semestr zimowy 2019/2020

lp  Wykładowca Data Temat
  1   Prof. dr hab. Marcin Filipecki Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Instytut Biologii, SGGW w Warszawie 25.10.2019 Czy CRISPR pomoże rolnictwu w Europie i na świecie?
  2   Mgr inż. Błażej Betliński Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Instytut Biologii, SGGW w Warszawie 08.11.2019 Rola CRK5 w molekularnych i komórkowych mechanizmach śmierci komórki w rzodkiewniku pospolitym (Arabidopsis thaliana).
  3   Dr Karolina Susek Zakład Genomiki, Zespół Struktury i Funkcji Genów, Instytut Genetyki Polska Akademii Nauk, Poznań 24.01.2020 Ewolucja genomów roślinnych: analiza porównawcza chromosomów łubinów.  
  4   Dr Damian Witoń Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Instytut Biologii, SGGW w Warszawie 22.11.2019 Komórkowa złożoność kaskady sygnalnej MAPK: pytania i nowe narzędzia, aby na nie odpowiedzieć.
  5   Prof. dr hab. Joanna Kargul Laboratorium Fotosyntezy i Paliw Słonecznych Centrum Nowych technologii Uniwersytetu Warszawskiego 29.11.2019 Ekstremalna fotosynteza w obliczu wyzwań klimatycznych i energetycznych.  
    6 Dr inż. Tomasz Krępski Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Instytut Biologii, SGGW w Warszawie 06.12.2019 Wpływ wybranych czynników środowiska na ekspresję genów regulonu CBF u traw podczas ich hartowania na mróz.              
  7   Dr Marek Żurczak Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Instytut Biologii, SGGW w Warszawie 13.12.2019 Dynamika proteomu korzeni pomidora podczas ataku mątwika ziemniaczanego
  8   Mgr inż. Ewa Borzęcka Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Instytut Biologii, SGGW w Warszawie 10.01.2020 Zagęszczenie szkieletu mapy fizycznej żyta i charakterystyka regionów genomu, na które wywierana była presja selekcyjna w trakcie udomowienia i hodowli żyta.
  9 Mgr inż. Katarzyna Tofil Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin, Instytut Biologii, SGGW w Warszawie 17.01.2020 Konstrukcja zintegrowanej, silnie zagęszczonej mapy genetycznej żyta dla lokalizacji regionów genomu poddanych presji selekcyjnej.

Wyniki badań w 2018 roku


Genetic mapping of psl locus and quantitative trait loci for angular leaf spot resistance in cucumber (Cucumis sativus L.)

Zagęszczanie mapy genetycznej ogórka w obrębie loci odporności na kanciastą plamistość

Construction of genetic map for cucumber and mapping of psl gene and QTL for angular leaf spot resistance

Transcriptomic response of resistant and susceptible cucumber lines to Pseudomonas syringae pv. lachrymans

Szkoła letnia „Genomics for Plant Breeding and Biotechnology”

W dniach 19-25 sierpnia 2018 odbyła się Szkoła Letnia „Genomics for Plant Breeding and Biotechnology” organizowana w ramach sieci Euroleague for Life Sciences (ELLS).

Uczestnicy Szkoły wraz z wykładowcami

ELLS to sieć wiodących uniwersytetów współpracujących w dziedzinie zarządzania zasobami naturalnymi, nauk rolniczych i leśnych, nauk biologicznych, weterynarii, nauk o żywności i nauk o środowisku. SGGW również należy do Euroligi.

W sierpniu nasza Katedra przeprowadziła szkołę letnią dotyczącą genomiki w hodowli i biotechnologii roślin. W szkole uczestniczyło 24 studentów oraz doktorantów z 14 uniwersytetów, m.in. Al–Farabi Kazakh National University w Kazachstanie, University of Natural Resources and Life Sciences (BOKU) w Austrii, czy Universidad Nacional Agraria La Molina w Peru. Uczestnicy wzięli udział w serii wykładów oraz praktycznych ćwiczeń bioinformatycznych i laboratoryjnych, obejmujących różne aspekty genomiki związane z hodowlą roślin i biotechnologią, takie jak: metody sekwencjonowania nowej generacji, analiza danych RNASeq, mikro RNA, genotypowanie poprzez sekwencjonowanie, biologia syntetyczna i hodowla molekularna, kultura tkanek roślinnych i wiele innych. Temat selekcji genomowej przybliżył gość ze Szwedzkiego Uniwersytetu Nauk Rolniczych, prof. Rodomiro Ortiz.

Ponadto uczestnicy szkoły letniej wzięli udział w warsztatach prowadzonych przez dr hab. Leszka A. Łyżnika, dotyczących tworzenia Start-up’ów wykorzystujących biotechnologię roślin. Częścią warsztatów była wycieczka do firmy biotechnologicznej Biolabinvest (zlokalizowanej w Kajetanach pod Warszawą) oraz prezentacja projektów wykonanych podczas zajęć.

Wyniki badań w 2017 roku


Genome analysis of Pseudomonas syringae pv. lachrymans strain 814/98 indicates diversity within the pathovar

Type III virulence effectors in Pseudomonas syringae pv. lachrymans strain 814/98

Genetic mapping of angular leaf spot resistance in cucumber (Cucumis sativus L.)

Poszukiwanie genów referencyjnych na potrzeby analizy ekspresji genów po zainfekowaniu roślin ogórka Pseudomonas syringae pv. lachrymans

RNA-seq analysis of resistant and susceptible cucumber plants infected with Pseudomonas syringae pv. lachrymans